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-Shadow Games (Tomo 1 - Tomo 4, Duel 24)

No es una saga en si, el manga de Yu-Gi-Oh! comienza con varias historias cortas, pocas pasan de los 2 capitulos, a medida que se desarrollan algunos personajes y aparecen diversos Juegos de las Sombras que involucran azar, ingenio y estrategia

la "mayoria" de estas historias fueron adaptadas en el primer anime de Yu-Gi-Oh!

-Death-T (Tomo 4, Duel 25 - Tomo 5, Duel 40)

Torre de la Muerte es lo que se podria llamar la primer saga, este arco fue adaptado en el primer anime de Yu-Gi-Oh! y tambien de aqui se toman varias cosas para lo que fue el primer capitulo del segundo anime (el rapto del abuelo, el duelo Kaiba vs Yugi, la aparicion de Exodia)

en resumen, Kaiba quiere vengarse de Yugi por derrotarlo forzando a Yugi y sus amigos a participar del evento de inauguracion en su parque de atracciones para

Yugi debe atravezar todos los pisos de la torre para llegar hasta Kaiba, en cada piso encuentra un desafio diferente

en el manga es aqui donde Yugi les revela a sus amigos que "su otro yo" es quien aparece cuando enfrenta un desafio, cosa que en Duel Monsters, el segundo anime, paso durante el Duelo de Yami vs Bakura durante la saga del Reino de los Duelistas

-Monster World (Tomo 6, Duel 50 - Tomo 7, Duel 59)

Este arco tambien se adapto en el primer anime de Yu-Gi-Oh! y en el segundo anime el Duelo de Yami vs Bakura durante la saga del Reino de los Duelistas es una especie de version de los paso en esta saga

Bakura aparece por primera vez, se hace amigo de Yugi y los demas, el espiritu del la Sortija del Milenio les tiende una trampa para quedarse con el Rompecabezas del Milenio utilizando un Juego de las Sombras que involucra un juego de rol

-Duelist Kingdom (Tomo 7, Duel 60 - Tomo 15, Duel 133)

El Reino de los Duelistas fue adaptado durante la primer temporada de D.M., el segundo anime de Yu-Gi-Oh!, si viste el anime ya sabes que ocurre

-Dungeon Dice Monsters (Tomo 16, Duel 134 - Tomo 17, Duel 145)

Este arco tambien se adapto en la primer temporada de D.M. Otogi/Duke Devlin quiere vengarse de Yugi, en el anime lo hace para vengar a Pegasus pero en el manga originalmente tenia un motivo diferente

-Battle City (Tomo 17, Duel 146 - Tomo 31, Duel 278)

Otro arco que adaptaron en el anime de D.M. pero esta ves durante su segunda temporada y el final de la tercera.

-Millennium World (Tomo 32, Duel 279 - Tomo 38, Duel 338)

Este arco fue adaptado durante la quinta temporada de D.M. (El Amanecer del Duelo)

-The Ceremonial Battle (Tomo 38, Duel 339 - Duel 343)

Arco final, mostrando el duelo de Yugi vs Atem, tambien adaptado en la quinta temporada de D.M.

solo faltaria nombrar el manga de Yu-Gi-Oh! R, aunque no es reconocido como canonico, podria encajar casi perfecto con el manga original

temporalmente se ubica despues de Ciudad Batallas, Yakou Tenma, hijo adoptivo de Pegasus busca vengarse de Yugi y revivir a Pegasus (en el manga Pegasus murio durante el final del Reino de los Duelistas) usando a Anzu/Tea y el poder de los Wicked Gods, versiones demoniacas de los Dioses Egipcios

Aqui esta la informacion que necesitas:

http://es.wikipedia.org/wiki/Yu-Gi-Oh!