El problema es que si nunca hiciste ese backup con el telefono roto, al respaldar con el emulador, ese respaldo es el que manda. Y si lo hiciste, tenias que haber recuperado el backu en vez de crearlo de nuevo, por que entonces lo sobreescribes.

El problema es que ahora con el telefono arreglado (o eso he entendido) has recuperar el backup que hiciste desde el emu, y eso sobreescribe lo que tenias, ergo, lo has perdido. Esas copias se hacen a tu drive si no recuerdo mal, quizas tengas algo ahí, compruebalo. Si aun están ahí, ya no sabria muy bien como recuperarlo. hace años que mande a wazap a tomar por... Así que lo que te digo es basado en lo que recuerdo.

Lo que tenias que haber hecho desde el emu era recuperar backup (si es que lo habia) del telefono para que se "acumulara" y lo mismo en el telefono para que recuperase todo incluido lo generado con el emu.